Sasaran IAIN Kendari
- Terwujudnya penguatan tata kelola PTKI (Good Islamic University Governance) Tahun 2016 – 2020;
- Terwujudnya PTKI Berkelas Sulawesi Tenggara (Southeast Sulawesi Class Islamic University) Tahun 2021 – 2025;
- Terwujudnya PTKI Berkelas Kawasan Timur Indonesia (Indonesia Eastern Class Islamic University) Tahun 2026 – 2030;
- Terwujudnya PTKI Berkelas Indonesia (Indonesia Class Islamic University) Tahun 2031 – 2035;
- Terwujudnya PTKI Berkelas Asia Tenggara (Southeast Asia Class Islamic University) Tahun 2036 – 2040;
- Terwujudnya PTKI Berkelas Asia (Asian Class Islamic University) Tahun 2041–2045.
SK Tentang Penetapan VIsi Misi, Sasaran dan Tujuan di download melalui Link ini